Análisis bioinformático del ADN de “hongos de madera” que afectan a Persea americana, Ayacucho -Perú.
DOI:
https://doi.org/10.51440/unsch.revistainvestigacion.32.1.2025.618Palabras clave:
BLASTN, Lasiodiplodia, PCR, ITS, Persea americanaResumen
Con los objetivo de estandarizar PCR para ADN de “hongos de madera” en Palto (Persea americana), secuenciar ADN genómico producto de PCR para genes ITS y analizar con bioinformática las secuencias de ADN a la base de datos del NCBI; se extrajo ADN genómico a partir de micelios de in vitro de “hongos de madera” de palto (P. americana). Con los primer ITS1 y ITS4 se realizó el PCR y el producto fue secuenciado en plataforma ILLUMINA HiSeq. Las secuencias fueron evaluadas con herramientas bioinformáticas FastQC, el alineamiento a la base de datos del NCBI mediante el software BLASTN. Se identificó molecularmente que las secuencias de ADN del “hongo de madera” corresponde al fitopatógeno Lasiodiplodia theobromae (Molecular E value=0.0, % identidad=98), afectando al Palto (P. americana) en las condiciones de Ayacucho.
Descargas
Citas
Alvarez, L. A., Garcia, M. a. A., & Hinojoza, J. L. T. (2019). Influence of the pattern on the severity of Pasiodiplodia theobromae ((Pat.) Griffon & Maubl.) infections in avocado (Persea americana Mill.) var. Hasso. Mol,19, 70-76. https://www.cabdirect.org/ cabdirect/abstract/20219948714
Charron, G., Gauthier, M.-K., Heyden, H. van der, Bilodeau, G. J., & Tanguay, P. (2024). A qPCR assay for the detection of Phytophthora abietivora, an emerging pathogen on fir species cultivated as Christmas trees (p.2024.09.03.610995). bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2024.09.03.610995
Hilário, S., Amaral, I. A., Gonçalves, M. F. M., Lopes, A., Santos, L., & Alves, A. (2020).Diaporthe species associated with twig blight and dieback of Vaccinium corymbosum in Portugal, with description of four new species. Mycologia, 112(2), 293-308. https://doi. org/10.1080/00275514.2019.1698926
Huanca, W., Salvatierra Martinez, R., & Sepúlveda, G. (2014). A fast and efficient method for total DNA extraction from soil filamentous fungi. Idesia (Arica), 32, 75-78. https://doi.org/10.4067/ S0718-34292014000200010
Jeyaprakash, A., Davison, D. A., & Schubert, T. S. (2014). Molecular Detection of the Laurel Wilt Fungus, Raffaelea lauricola. Plant Disease, 98(4), 559-564. https:/doi.org/10.1094/PDIS-08-13 0894-RE
Pem, D., Jeewon, R., Selcuk, F., Ulukapi, M., Bhat, J., Doilom, M., Lumyong, S., & Hyde, K. D. (2020). Ribosomal and Protein Gene Phylogeny Reveals Novel Saprobic Fungal Species From Juglans regia and Urtica dioica. Frontiers in Microbiology, 11. https:// doi.org/10.3389/fmicb.2020.01303
Pornsuriya, C., Thaochan, N., Chairin, T., & Sunpapao, A. (2023). Morphological and Phylogenetic Evidences Reveal Lasiodiplodia chonburiensis and L. theobromae Associated with Leaf Blight in Hevea brasiliensis in Southern Thailand. Diversity, 15(9), Article 9. https://doi.org/10.3390/d15090961
Rodríguez-Gálvez, E., Hilário, S., Batista, E., Lopes, A., & Alves, A. (2021). Lasiodiplodia species associated with dieback of avocado in the coastal área of Peru. European Journal of Plant Pathology, 161(1), 219-232. https://doi. org/10.1007/s10658-021- 02317-5
Rojas-Villalta, D., Benavides-Villegas, D., Angulo-Hidalgo, B., Muñoz-Solórzano, L., Consumi-Tubito, C., Rojas-Villalta, D., Benavides-Villegas, D., AnguloHidalgo, B.,
Muñoz-Solórzano, L., & Consumi-Tubito, C. (2024). Caracterización de las tecnologías de secuenciación genética de segunda y tercera generación. Revista Tecnología en Marcha, 37(2), 70-81.https://doi.org/10.18845/tm.v37i2.6494
Toapanta Gallegos, D. E. (2017). Diagnóstico molecular de Phytophthora cinnamomi asociado a la pudrición radicular en zonas productoras de aguacate en Ecuador. Corpoica Ciencia y Tecnología Agropecuaria, 18(2), 285. https://doi.org/10.21930/rcta.vol18_num2_art:628
Valencia, A. L., Saavedra-Torrico, J., Rosales, I. M., Mártiz, J., Retamales, A., Link, A., & Gil, P. M. (2022). Unveiling the Predisposing Factors for the Development of Branch Canker and Dieback in Avocado: A Case of Study in Chilean Orchards. Horticulturae, 8(12), Article 12. https://doi.org/10.3390/horticulturae8121121
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0.
